乙型肝炎（簡稱「乙肝」）是由乙肝病毒引起的一種以肝臟炎症性病變爲主的傳染病。中醫學認爲乙肝由外在及內在因素導致，兩者缺一不可，外因是指患者身體受濕熱疫毒之邪（即乙肝病毒）侵入，內因是指身體正氣（即免疫功能）不足，臟腑功能失調。如濕熱疫毒之邪久留體內，可導致氣血瘀阻，經絡不通，最終造成肝脾腎受損，嚴重者會演變爲肝硬化或肝癌。因此，中醫治療乙肝時，不僅著眼於「祛邪」，直接清除濕熱疫毒之邪，還注重「扶正」，通過扶助人體正氣來清除病毒，並注意調理氣血臟腑功能，治療臟腑虛損。
中醫學主要用中藥治療乙肝，經多年的臨床與實驗研究，顯示中醫藥在乙肝治療中可以改善或消除患者的不適症狀；可以改善肝功能，包括肝酵素、黃疸（膽紅素）指標，蛋白代謝指標等；可以抑制乙肝病毒，改善肝纖維化的情況，並在一定程度上減低肝硬化及肝癌的發病率；如選藥及用量恰當，其副作用會較少，療效也較穩定。
中醫師會運用「辨證論治」或「辨病治療」來處方用藥。「辨證論治」是按乙肝患者不同的體質及臨床表現劃分為不同的證型，例如濕熱內蘊型、濕濁中阻型、肝鬱氣滯型、肝鬱脾虛型、肝腎陰虛型、脾腎陽虛型，以及瘀血阻絡型等，然後針對每位患者的證型特性來用藥治療。
至於「辨病治療」，則是針對患者的共同特點來處方用藥，通常會選用已經過臨床研究或中藥藥理研究顯示對乙肝病毒及其肝損害有治療作用的中藥來進行治療。例如：抑制或清除乙肝病毒，可選用白花蛇舌草、葉下珠、半枝蓮、土茯苓、土茵陳、板藍根、仙鶴草、夏枯草等。利膽退黃，可選用柴胡、綿茵陳、梔子、溪黃草、雞骨草、田基黃、赤芍、大黃、郁金、金錢草等。降低肝酵素，可選用五味子、垂盆草、敗醬草、田基黃、蒲公英、葛根、豬苓、女貞子等。調整蛋白代謝、提升白蛋白，可選用生地、黃芪、黨參、白術、紫河車、龜板、大棗、刺五加、阿膠、黃精、杞子等。抗肝纖維化，可選用丹參、紅花、三七、鼈甲、川芎、冬蟲夏草、三棱、莪術等。
乙肝患者使用中藥治療時，應由有經驗的註冊中醫師診治，遵循醫囑用藥，不宜自行服藥；接受治療期間，不宜使用對肝有損害的中藥、西藥或中成藥；此外，須注意中藥的用藥量、合理搭配及交替應用，尤其是在治療乙肝期間同時出現其他疾病的時候；由於慢性乙肝治療的療程較長，患者須堅持治療，不宜半途而廢；在完成一個療程後，可在醫師的指導下適當停藥若干時間再繼續下一療程。
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