造成急性腎盂腎炎轉慢性的原因，多數是因急性期治療不徹底所致。由於急性期症狀經治療後，往往在短短的兩三天內就消失，患者常誤以為已痊癒而終止治療。殊不知，症狀消失並不等於治癒，而應當在尿液中的致病菌（多數為大腸桿菌）完全消失，且經兩次復查（培養）陰性之後，方可停藥。一般療程都要在兩週左右，甚至更長。
急性腎盂腎炎轉慢性的另一原因是反覆感染，即不注意外陰部、肛門的清潔衛生，或性生活不潔所致。
為了防止急性腎盂腎炎轉慢性，就應做到：
一、急性期不可因症狀消失而中斷治療，應當聽從醫囑，堅持治療直至痊癒。
二、講究衛生，經常清洗外陰部及肛門，注意經期及性生活衛生，多飲水，常排尿，不要待到尿急了才排尿。
三、加強體育鍛鍊，注意營養，增強抵抗力，以防反覆感染。
四、有婦科慢性炎症疾患如盆腔炎等，亦應徹底治療，以防蔓延感染至腎盂。
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