《國際衛生條例（2005）》並未列入對不遵守條例的國家強制執行的機制，只在網頁中表明「不遵守的潛在後果本身就是強而有力的遵守工具。也許鼓勵遵守的最好辦法是『同伴的壓力』和公的認識。有了當今的電子媒體，沒有事情能夠隱瞞很久。各國不願被孤立。而不遵守的後果可能有﹕敗壞國際形象、發病率/死亡率增加、單邊的旅行和貿易限制、經濟和社會混亂，以及公暴力行為」。
姑勿論後果是否如此，以是次甲型H1N1流感事件為例，就有國家不遵守條款，例如沒定期上報感染數字。
美國國土安全部長納波利塔諾在世衛提升警戒級別後說﹕「從新型流感爆發開始，美國已假設它會廣泛蔓延來應對，因此對世衛的決定不感意外，現在我們面對的挑戰，是準備應付今秋病毒可能捲土重來。」美國當局不會改變應對措施，美國疾病控制及預防中心（CDC）不再公布感染人數。
日本衛生當局在5月下旬宣布，不會再隔離感染甲型H1N1流感的人，也會取消有關入境檢查，因為病毒不易致命。日本截至6月17日最少有666人確診。
英國衛生部門表示﹕「世衛提升流感級別不應令人感到驚慌，這不會改變我們的預防措施，因此人們不必為此擔心。英國已做好幾個月甚至幾年的準備。」在世衛力指不用發出旅遊警告之下，英國外交部4月尾曾宣布對墨西哥發出旅遊警告，5月中已取消。
世衛代理助理秘書長福田敬二曾說﹕「感染數字本身已經變得有點無關緊要，數字將日漸無法反映疫情。但部分國家（如美國）決定不檢驗、不統計每個甲型H1N1流感個案是『情有可原』（justifiably avoiding to...），因為這會令化驗室資源過度緊繃。」
香港大學感染及傳染病中心總監何良說﹕「國際社會包括本港在內，對美國的做法也無可奈何，反正美國公布的感染新流感數字亦遠遠低於實際感染人數，連世衛也管不到。」他希望國際社會強烈促請美國CDC不要封鎖資訊，要即時公布新流感死亡個案，以及公布死亡原因、死亡速度、病理化驗和解剖結果等資料，讓國際社會盡快了解新流感病毒的發展，根據死亡率和死亡原因等進一步了解病毒之殺傷力。
世衛總幹事陳馮富珍回應部分國家決定不檢驗、不統計個案的做法時表示，新流感病毒「是一種難以捉摸、鬼祟的病毒，它不會一來到就導致病人數目暴增，反而令許多國家實驗室檢驗次數暴增，以偵測和追蹤」，這使衛生體系進退兩難，多國要投入嚴格檢測和調查，研究臨案例，「很麻煩和極度耗費資源」。對於多國質疑這些做法「能撐多久」，她表示，世衛目前無法使用一套普世指導方針解決這兩難，「各國應隨疫情演變來調整應對方式」。
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